《妹妹公主》是一款戀愛養成遊戲，玩家可以和12個妹妹中的任意一個發展戀愛關系。遊戲的劇情是一個全新的故事，就像他的標題一樣，劇情上的設定是近原作小說版，也就是哥哥是和12位妹妹分開居住的，完全采用小說版的各種設定，每個妹妹都有各自的家，彼此相聚，然後…離別，所以在本作中，可以隱約的感覺的原作小說版的氣息！遊戲包含隱藏劇情，也可能是未被用到的文本，但進入方法未知。

所謂「妹妹」，其實是突顯主角「兄」（即讀者）的象征性。在原作版上並沒有一個實際的「兄」的存在，大概是希望讀者能代入其中享受「妹妹」的愛之余也能愛護「妹妹」。原作版上12個「妹妹」每一個都是獨立的存在。改編動畫和遊戲時才將「兄」實體化。在遊戲中玩家可選擇「妹妹」是否有血緣關系。

在1999年三月，雜誌出版社MediaWorks（現稱ASCIIMediaWorks）所出版的雜誌電擊G's雜誌推出一個名為「妹妹公主」的讀者參與計劃。當時「妹妹」的數量只有九個。在2000年時，根據當時讀者意見再加入由德國、英國與法國回到日本的三個新「妹妹」。2001年3月8日，遊戲版於PlayStation主機發售。在2001年及2002年兩度動畫化，不過兩套動畫妹妹公主和妹妹公主RePure劇情並不相連。