主人公（昂）是陽光之城的一個組織，光之牙的成員。他們參加了一場與他們的對手組織「夜之鴉」的傳統比賽，盡管他們是新成員，但還是成功地贏得了3場比賽。他們在比賽中累了，就上床睡覺了，只有在城市裏有一場大地震，伴隨著一種神秘的能量生命形式的出現，就在那天晚上!它導致許多數碼寶貝退化為數碼蛋，並對接入點造成相當大的損害。當主角註意到有什麽東西出了問題，沖向城市時，這座城市已經遭受了巨大的破壞，連接城市和暗月城的橋梁也被摧毀了。關於這一事件的傳聞開始蔓延，主角開始了一段恢復城市的旅程，並找出了神秘的生命形式背後的真相。